清朝入主中原初期，统治根基尚未稳固。面对南方此起彼伏的抗清势力与复杂的军政局面，清廷采取了“以汉制汉”的策略。在此背景下，三位明朝降将——镇守云南的平西王吴三桂、镇守广东的平南王尚可喜、镇守福建的靖南王耿精忠，因其在平定南明与农民军过程中的显赫战功，被授予藩王称号，形成了清初著名的“三藩”。他们不仅拥有独立的军事指挥权，还能掌控辖地的财政与官吏任免，势力日渐坐大，渐成尾大不掉之势。
三藩之中，尤以吴三桂势力最为雄厚。他坐拥精锐边军，麾下“西选”官员遍布各地，几乎形成独立于朝廷之外的官僚体系。其在云南广占田庄、垄断盐铁、私开矿铸，财政自成一体。耿精忠、尚可喜及其子尚之信在福建、广东 likewise 专横跋扈，苛征暴敛。三藩每年耗费朝廷巨额饷银，几乎占据全国赋税之半，对年轻的康熙王朝构成了巨大的财政与政治压力。随着时间推移，地方藩镇与中央朝廷的矛盾日益尖锐，削藩已成为必然的历史抉择。
康熙帝亲政后，将“三藩、河务、漕运”列为三大心病。1673年，平南王尚可喜上疏请求归老辽东，康熙顺势决定全面撤藩。此举触动了吴三桂与耿精忠的根本利益。同年十一月，吴三桂诛杀朝廷命官，打出“兴明讨虏”旗号，自称“天下都招讨兵马大元帅”，正式起兵反清。叛军迅速席卷云贵，进占湖南，并联络各地旧部，一时间，福建、广东、广西、四川、陕西等多地响应，清廷半壁江山为之震动。
战争初期，吴军势如破竹。然而康熙帝展现出卓越的政治手腕与军事眼光。他采取了“重点打击，分化瓦解”的策略：集中力量打击首恶吴三桂，对耿精忠、尚之信等人则进行招抚。同时，大胆任用汉将，鼓舞士气。1676年后，战局发生转折，王辅臣在西北降清，耿精忠、尚之信也相继归顺。陷入孤立的吴三桂于1678年在衡州仓促称帝，国号“周”，但已是强弩之末。同年秋，吴三桂病逝，其孙吴世璠继位，叛军士气崩溃。
1681年，清军攻破昆明，吴世璠自杀，历时八年的三藩之乱终告平定。这场战争是清朝确立绝对统治的关键一役。战后，清廷彻底废除藩镇制度，将藩产收归国有，兵力编入八旗或绿营，并在关键城市派驻八旗重兵，极大加强了中央集权。战争的胜利也为随后收复台湾、解决西北噶尔丹问题奠定了基础，标志着清朝完成了真正意义上的全国统一，统治进入稳定期。
后世对三藩之乱的评价存在多个维度。一种观点认为，康熙帝急于撤藩，策略失当，未能妥善安置，直接将雄踞一方的军阀逼上绝路，导致生灵涂炭，四川等地人口锐减，经济遭受重创，清军在平叛过程中的某些过激行为也备受诟病。另一种主流史观则强调，削藩是维护国家统一的必然之举，长痛不如短痛。吴三桂虽以“复明”为号，但其本人曾是绞杀南明势力的元凶，政治号召力存疑，其起事本质仍是地方割据势力与中央政权的权力争夺。这场动乱最终以中央胜利告终，客观上巩固了多民族国家的统一格局。
